江南新区党工委、管委会合署办公，作为万州区委、区人民政府的派出机构，负责统一管理辖区的开发建设和经济社会事务，按照“小政府、大服务”的运行管理模式，内设职能局室6个；经重庆市人民银行批准，设立了江南新区一级国家(支)金库；公安、国税、地税、工商等部门向新区派驻了分支机构。
    按照经营城市的理念，江南新区坚持高标准规划、高质量建设、高水平管理，有序推进土地、基础设施等城市资源的市场化进程；实行土地一级垄断开发，土地二级及其以外市场面向区内外开放，市场化运作模式。由重庆市万州江南新区开发建设有限公司、重庆市万州区南滨开发建设有限公司等作为业主，负责承担新区基础设施建设和土地整治开发。
    以“建设山水新城，打造库区明珠”为宗旨，江南新区开发建设总体目标是：加快开发建设进程，积极打造生态江南、宜居江南，到2020年，构建起陈家坝综合片区、联合坝物流仓储片区、沱口港口物流片区、密溪沟休闲度假片区等四大片区，建成区面积达到9平方公里，总人口达到10万人以上，形成具备行政、文化、商住、休闲、港口等核心功能的新城。